¿Cómo se generan las esculturas?

Para encontrar la microbiodiversidad presente en una muestra de suelo, la técnica de secuenciación llamada Metabarcoding se lleva a cabo extrayendo un gen específico de los microorganismos presentes, el gen 16S. Este gen, que es solo un fragmento de su código genético, nos da toda la información necesaria para identificar las diferentes especies de bacterias y hongos. Con el proceso de secuenciación, el ADN que se ha separado para este fin es convertido de información biológica a información digital; cada una de las bases nitrogenadas se convierte, en nuestros computadores, en una de las letras: A, C, G, T.

Una vez tenemos la información digital, que es un largo texto escrito con las letras mencionadas, lo convertimos a código binario, que nos permite activar o desactivar las células de una cuadrícula del Juego de la vida conocido como un autómata celular. Así, cada letra está compuesta de dos células, que pueden estar encendidas o apagadas, y la cuadrícula tiene el tamaño justo que corresponde a la longitud de bases nitrogenadas del gen 16S de la bacteria seleccionada.

Con esta cuadrícula y el código entero del gen 16S de la bacteria convertido en celdas del juego, iniciamos el Juego de la vida, en el que cada iteración genera una nueva capa de información binaria del código, como siguiente generación del juego. Así se construye la versión tridimensional del código genético en una escultura que lo expresa. Al permitir que el juego se ejecute por una cierta cantidad de repeticiones, escogemos las configuraciones que entren en el filo del caos planteado por Langton (1991) (bautizado con ese nombre por Norman Packard del Santa Fe Institute a finales de los 80's).Es decir, el umbral donde el sistema dinámico manifiesta un orden complejo y ultrasensible, en el que presentan una enorme variedad de patrones frente a los cuales no existe una descripción breve y unitaria. Estas son aquellas configuraciones que permiten que patrones de complejidad emerjan dando lugar a nuevos ecosistemas artificiales (AcostaYaver, 2017) que se plasman en la escultura como resultado "fenotípico" del código que se va autoconstruyendo.

El Juego de la vida es uno de los primeros ejemplos de vida artificial de Autómatas Celulares, creado por  John Horton Conway. Se trata de un programa de computador que con reglas muy sencillas busca imitar el comportamiento de los organismos vivos. Estas son las reglas: 1. Si una célula está viva y tiene dos o tres vecinas vivas, sobrevive. 2. Si una célula está muerta y tiene tres vecinas vivas, nace. 3. Si una célula está viva y tiene más de tres vecinas vivas, muere por sobrepoblación. 4. Si una célula está viva y tiene menos de 2 vecinas, muere.

La escultura que se presenta a continuación se generó con el software de programación visual Grasshopper (plug-in de Rhinoceros 3D) junto a los plugins de "anemone" y de voxelización para Windows. Esta escultura deriva del gen 16S de la bacteria Chondromyces Apiculatus encontrada en el Parque Entre Nubes. El gen tiene 1400 pares de bases nitrogenadas, que al duplicar su cantidad por ser traducida a código binario da como resultado una cuadrícula aproximada de 53 por 53. El juego se ejecutó por 106 iteraciones generacionales.